Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms