Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIAQ12857 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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