Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STX4Q12846 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STX4Q12846 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
STX4Q12846 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
STX4Q12846 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
STX4Q12846 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms