Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms