Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC1Q08554 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms