Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms