Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms