Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms