Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CD164Q04900 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CD164Q04900 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms