Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms