Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms