Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLH2Q02577 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms