Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN7AQ01118 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms