Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HSF1Q00613 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms