Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX6P78412 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX6P78412 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX6P78412 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX6P78412 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX6P78412 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX6P78412 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX6P78412 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX6P78412 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX6P78412 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX6P78412 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX6P78412 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX6P78412 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX6P78412 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX6P78412 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX6P78412 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX6P78412 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX6P78412 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX6P78412 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX6P78412 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX6P78412 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX6P78412 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX6P78412 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX6P78412 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX6P78412 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX6P78412 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX6P78412 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX6P78412 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX6P78412 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX6P78412 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX6P78412 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX6P78412 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX6P78412 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX6P78412 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX6P78412 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX6P78412 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX6P78412 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX6P78412 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX6P78412 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX6P78412 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX6P78412 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX6P78412 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX6P78412 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX6P78412 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX6P78412 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX6P78412 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX6P78412 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX6P78412 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX6P78412 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX6P78412 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX6P78412 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX6P78412 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX6P78412 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX6P78412 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX6P78412 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX6P78412 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX6P78412 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX6P78412 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX6P78412 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX6P78412 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX6P78412 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX6P78412 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX6P78412 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX6P78412 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX6P78412 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX6P78412 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX6P78412 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX6P78412 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX6P78412 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX6P78412 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX6P78412 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX6P78412 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX6P78412 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX6P78412 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX6P78412 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX6P78412 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX6P78412 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX6P78412 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX6P78412 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms