Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB1AP62820 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB1AP62820 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1AP62820 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms