Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UFM1P61960 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
UFM1P61960 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
UFM1P61960 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
UFM1P61960 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFM1P61960 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms