Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P61574 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms