Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BACE1P56817 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BACE1P56817 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BACE1P56817 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BACE1P56817 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BACE1P56817 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BACE1P56817 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BACE1P56817 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BACE1P56817 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BACE1P56817 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BACE1P56817 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
BACE1P56817 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BACE1P56817 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BACE1P56817 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BACE1P56817 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BACE1P56817 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BACE1P56817 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BACE1P56817 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BACE1P56817 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BACE1P56817 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BACE1P56817 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BACE1P56817 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BACE1P56817 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BACE1P56817 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BACE1P56817 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BACE1P56817 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BACE1P56817 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BACE1P56817 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BACE1P56817 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BACE1P56817 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms