Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRPF1P55201 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms