Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRISP1P54107 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRISP1P54107 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms