Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms