Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DAP3P51398 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DAP3P51398 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms