Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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CENPFP49454 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPFP49454 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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CENPFP49454 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPFP49454 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPFP49454 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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CENPFP49454 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPFP49454 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPFP49454 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPFP49454 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPFP49454 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPFP49454 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPFP49454 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPFP49454 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPFP49454 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPFP49454 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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CENPFP49454 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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CENPFP49454 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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CENPFP49454 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPFP49454 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPFP49454 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPFP49454 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPFP49454 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPFP49454 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPFP49454 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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