Protein–RNA interactions for Protein: P49407

ARRB1, Beta-arrestin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRB1P49407 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARRB1P49407 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARRB1P49407 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms