Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU3F4P49335 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms