Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD2P49005 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD2P49005 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD2P49005 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLD2P49005 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD2P49005 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms