Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX1P48742 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX1P48742 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX1P48742 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX1P48742 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX1P48742 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms