Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms