Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSN1S1P47710 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSN1S1P47710 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSN1S1P47710 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSN1S1P47710 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSN1S1P47710 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSN1S1P47710 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSN1S1P47710 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms