Protein–RNA interactions for Protein: P46109

CRKL, Crk-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKLP46109 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRKLP46109 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRKLP46109 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRKLP46109 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRKLP46109 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRKLP46109 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRKLP46109 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRKLP46109 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRKLP46109 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRKLP46109 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRKLP46109 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRKLP46109 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRKLP46109 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CRKLP46109 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRKLP46109 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRKLP46109 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRKLP46109 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRKLP46109 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRKLP46109 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRKLP46109 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRKLP46109 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRKLP46109 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CRKLP46109 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRKLP46109 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRKLP46109 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRKLP46109 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRKLP46109 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRKLP46109 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRKLP46109 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRKLP46109 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRKLP46109 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRKLP46109 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRKLP46109 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRKLP46109 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRKLP46109 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRKLP46109 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRKLP46109 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRKLP46109 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRKLP46109 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRKLP46109 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms