Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRCA1P38398 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA1P38398 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms