Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJC1P36383 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJC1P36383 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJC1P36383 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJC1P36383 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJC1P36383 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJC1P36383 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJC1P36383 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJC1P36383 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJC1P36383 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJC1P36383 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJC1P36383 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJC1P36383 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJC1P36383 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJC1P36383 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJC1P36383 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJC1P36383 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJC1P36383 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJC1P36383 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJC1P36383 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJC1P36383 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJC1P36383 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJC1P36383 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GJC1P36383 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GJC1P36383 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJC1P36383 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJC1P36383 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJC1P36383 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
GJC1P36383 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJC1P36383 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJC1P36383 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJC1P36383 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GJC1P36383 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJC1P36383 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJC1P36383 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJC1P36383 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJC1P36383 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJC1P36383 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJC1P36383 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJC1P36383 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GJC1P36383 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms