Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
COPB2P35606 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
COPB2P35606 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
COPB2P35606 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPB2P35606 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB2P35606 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB2P35606 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB2P35606 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB2P35606 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB2P35606 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB2P35606 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPB2P35606 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms