Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms