Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRS3P32247 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRS3P32247 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRS3P32247 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BRS3P32247 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BRS3P32247 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms