Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms