Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTGFP29279 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTGFP29279 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTGFP29279 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTGFP29279 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTGFP29279 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTGFP29279 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTGFP29279 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTGFP29279 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTGFP29279 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTGFP29279 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTGFP29279 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTGFP29279 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTGFP29279 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTGFP29279 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTGFP29279 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTGFP29279 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTGFP29279 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTGFP29279 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTGFP29279 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTGFP29279 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CTGFP29279 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTGFP29279 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTGFP29279 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTGFP29279 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTGFP29279 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTGFP29279 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTGFP29279 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTGFP29279 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTGFP29279 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTGFP29279 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTGFP29279 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTGFP29279 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTGFP29279 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTGFP29279 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTGFP29279 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTGFP29279 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTGFP29279 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTGFP29279 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTGFP29279 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTGFP29279 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTGFP29279 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTGFP29279 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTGFP29279 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTGFP29279 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTGFP29279 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTGFP29279 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTGFP29279 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTGFP29279 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTGFP29279 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTGFP29279 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTGFP29279 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTGFP29279 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTGFP29279 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTGFP29279 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTGFP29279 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTGFP29279 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTGFP29279 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms