Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms