Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms