Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 GTF2E2-202ENST00000518445 426 ntTSL 51.95□□□□□ -2.14e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PAPD4-213ENST00000510721 522 ntTSL 21.33□□□□□ -2.21e-8■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.195e-9■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.155e-9■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PIP5K1A-209ENST00000454769 540 ntTSL 414.03□□□□□ -0.165e-9■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.415e-9■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PIP5K1A-203ENST00000368890 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.645e-9■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PIP5K1A-201ENST00000349792 3767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best)10.96□□□□□ -0.665e-9■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 PIP5K1A-208ENST00000447555 373 ntTSL 1 (best)5.65□□□□□ -1.55e-9■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 LPP-202ENST00000415906 888 ntTSL 26.44□□□□□ -1.385e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.238e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.258e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.121e-12■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 COPS7B-210ENST00000413197 2442 ntTSL 213.09□□□□□ -0.311e-12■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.331e-12■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.341e-12■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.351e-12■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.371e-12■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 COPS7B-208ENST00000412591 571 ntTSL 412.49□□□□□ -0.411e-12■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.451e-12■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.621e-12■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 COPS7B-209ENST00000412922 1935 ntTSL 510.64□□□□□ -0.711e-12■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.751e-12■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 COPS7B-214ENST00000449784 978 ntTSL 37.37□□□□□ -1.231e-12■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.361e-8■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 BLZF1-204ENST00000420531 795 ntTSL 311.77□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 BLZF1-205ENST00000426663 926 ntTSL 32.84□□□□□ -1.951e-8■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RAD51B-205ENST00000471583 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RAD51B-208ENST00000479335 1615 ntTSL 1 (best)8.83□□□□□ -11e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RAD51B-211ENST00000487861 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RAD51B-212ENST00000488612 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.431e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RAD51B-204ENST00000469165 1158 ntTSL 35.57□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RAD51B-219ENST00000554244 669 ntTSL 35.42□□□□□ -1.542e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RAD51B-202ENST00000460526 794 ntTSL 35.33□□□□□ -1.561e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RAD51B-207ENST00000478014 618 ntTSL 35.31□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RAD51B-214ENST00000497460 546 ntTSL 43.29□□□□□ -1.881e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RAD51B-213ENST00000492236 417 ntTSL 32.95□□□□□ -1.941e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RAD51B-216ENST00000553595 795 ntTSL 32.91□□□□□ -1.942e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.593e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.733e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 LCOR-208ENST00000493486 245 ntTSL 32.55□□□□□ -23e-10■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 CEP83-201ENST00000339839 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 CEP83-203ENST00000397809 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 CEP83-207ENST00000547232 2166 ntTSL 1 (best)10.14□□□□□ -0.793e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.883e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 LINC01811-202ENST00000424786 787 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.467e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 USP53-205ENST00000509769 4803 ntTSL 1 (best)3.54□□□□□ -1.842e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.062e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 ADGRE5-203ENST00000358600 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 ADGRE5-202ENST00000357355 3054 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 ADGRE5-207ENST00000587535 931 ntTSL 310.43□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 ADGRE5-201ENST00000242786 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.774e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 ADGRE5-214ENST00000592261 573 ntTSL 410.01□□□□□ -0.814e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 ADGRE5-211ENST00000591080 554 ntTSL 49.46□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 ADGRE5-204ENST00000586517 578 ntTSL 48.98□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 ADGRE5-208ENST00000587606 572 ntTSL 28□□□□□ -1.134e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 ADGRE5-209ENST00000587728 587 ntTSL 47.82□□□□□ -1.164e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.13e-18■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.543e-18■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.923e-18■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.583e-6■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 SUCLG1-206ENST00000487809 762 ntTSL 24.46□□□□□ -1.73e-6■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 SUCLG1-208ENST00000491123 1073 ntTSL 31.93□□□□□ -2.13e-6■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 TYW1-207ENST00000615572 3156 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.855e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 TYW1-201ENST00000359626 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 TYW1-202ENST00000361660 3255 ntTSL 1 (best)8.84□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 TYW1-206ENST00000495971 1302 ntTSL 28.7□□□□□ -1.025e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.513e-8■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 UBE2K-207ENST00000513231 871 ntTSL 1 (best)18.18■□□□□ 0.53e-8■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 UBE2K-202ENST00000438068 2262 ntTSL 217.43■□□□□ 0.383e-8■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.343e-8■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 UBE2K-206ENST00000510934 589 ntTSL 214.97□□□□□ -0.013e-8■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.043e-8■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 UBE2K-205ENST00000510719 566 ntTSL 37.5□□□□□ -1.213e-8■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.484e-10■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 TBC1D5-221ENST00000452492 581 ntTSL 313.79□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 TBC1D5-207ENST00000425944 591 ntTSL 49.18□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 TBC1D5-218ENST00000445294 623 ntTSL 28.36□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 TBC1D5-215ENST00000443499 681 ntTSL 58.18□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 TBC1D5-208ENST00000428355 757 ntTSL 38.18□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 TBC1D5-204ENST00000414349 687 ntTSL 38.15□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 TBC1D5-205ENST00000415814 852 ntTSL 37.88□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 TBC1D5-229ENST00000497531 672 ntTSL 37.78□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 TBC1D5-202ENST00000412981 592 ntTSL 37.78□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 TBC1D5-211ENST00000430169 492 ntTSL 37.35□□□□□ -1.232e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 TBC1D5-220ENST00000446863 557 ntTSL 46.58□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 TBC1D5-214ENST00000443386 561 ntTSL 44.56□□□□□ -1.682e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 TBC1D5-217ENST00000444756 545 ntTSL 44.56□□□□□ -1.682e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 ANO6-204ENST00000426898 2780 ntTSL 214.84□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 ANO6-206ENST00000550630 835 ntTSL 313.68□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 ARID2-204ENST00000427628 323 ntTSL 56.68□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 29.1
PTBP1P26599 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.383e-7■■■■■ 29.1
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 343.2 ms