Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTX3P26022 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTX3P26022 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms