Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSSP25774 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSSP25774 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSSP25774 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms