Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCC1P18754 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RCC1P18754 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCC1P18754 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms