Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms