Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFAP15692 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms