Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA1P15085 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA1P15085 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA1P15085 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA1P15085 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CPA1P15085 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA1P15085 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA1P15085 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA1P15085 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA1P15085 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA1P15085 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA1P15085 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA1P15085 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA1P15085 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA1P15085 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms