Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP1P11387 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP1P11387 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP1P11387 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP1P11387 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP1P11387 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP1P11387 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP1P11387 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP1P11387 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP1P11387 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP1P11387 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP1P11387 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP1P11387 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP1P11387 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP1P11387 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP1P11387 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP1P11387 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP1P11387 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP1P11387 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP1P11387 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP1P11387 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP1P11387 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP1P11387 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP1P11387 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP1P11387 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP1P11387 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP1P11387 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP1P11387 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP1P11387 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP1P11387 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP1P11387 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP1P11387 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP1P11387 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP1P11387 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP1P11387 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP1P11387 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP1P11387 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP1P11387 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP1P11387 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP1P11387 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP1P11387 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP1P11387 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP1P11387 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP1P11387 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP1P11387 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP1P11387 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP1P11387 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP1P11387 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP1P11387 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP1P11387 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP1P11387 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms