Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCF2P10911 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCF2P10911 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCF2P10911 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCF2P10911 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCF2P10911 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCF2P10911 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCF2P10911 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCF2P10911 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCF2P10911 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCF2P10911 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCF2P10911 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCF2P10911 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCF2P10911 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCF2P10911 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCF2P10911 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCF2P10911 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCF2P10911 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCF2P10911 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCF2P10911 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCF2P10911 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCF2P10911 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCF2P10911 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
MCF2P10911 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCF2P10911 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCF2P10911 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCF2P10911 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
MCF2P10911 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCF2P10911 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms