Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRFP10586 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms